以姓氏和建筑物命名。
因该村村民以樊姓居多,又因村中有一庙堂,故名。
清属南王保;1921年属南区曹庄村;1934年属第三区皇帝庙联保;1941年属商桥镇;1948年属商桥区1949年属台陈区;1958年属皇帝庙公社属樊堂管理区;1961年属台陈区;1965年属皇帝庙公社樊堂大队;1984年属皇帝庙乡樊堂村委会。