以姓氏和地理位置命名。
相传吴姓兄弟二人,明初自山西洪洞县迁此建村,分居南北两处,本村居北,为后吴庄。
清属岔曲保;1921年属南区王曲街;1934年属第三区水车梁联保;1941年属商桥镇第一保;1949年属台陈区;1958年属王曲公社;1962年属台陈区;1965年属台陈区公社祁庄大队;1984年属台陈乡祁庄村民委员会;1997年属台陈镇祁庄村民委员会。