以姓氏命名。
相传祁姓于明朝末自城东北祁庄分居于此,故名,曾名龙渠庙。
清属岔曲保;1921年属南区王曲街;1934年属第三区水车梁联保;1941年属商桥镇第一保;1949年属台陈区;1958年属王曲公社;1962年属台陈区;1965年属台陈区公社祁庄大队;1984年属台陈乡祁庄村民委员会;1997年属台陈镇祁庄村民委员会。