因村民委员会驻南陈村而得名。
明弘治七年,陈氏始祖陈爵,从郾城县大陈庄迁此建村,始名陈庄。因在吴城镇南边一小河之南,曾名河南陈。后简称今名。
明、清属吴城保;1931年属第二区吴城镇;1943年属吴城镇;1949年属第二区;1958年属吴城人民公社,为南陈大队;1984年属吴城乡,为南陈村民委员会;1988年吴城乡撤乡建镇改为吴城镇,仍属之。