因村委会驻鹿店村而得名。
明洪武二年,鹿氏兄弟二人从山西洪洞县迁舞,弟定居鹿庄,兄在此建村,大道旁设有食宿店,故名鹿店庄;后简称今名。
明、清属灰河保;1931年属第七区,设鹿店乡;1943年属定陵镇;1948年属沙北县第四区;1949年属舞阳县第九区田吕乡;1958年属北舞渡公社鹿店大队;1984年春为北舞渡乡鹿店村民委员会;1988年北舞渡乡撤乡建镇,仍属之。