因村委会驻玉皇庙村而得名。
明代,蔡氏始祖从山西洪洞县迁此建村,因西南隅建有玉皇庙,故名。
明、清属徐庄保;1931年属第七区后蔡乡;1943年属清和乡;1949年属第九区;1958年属拐子王人民公社,为玉皇庙大队;1984年属拐子王乡,为玉皇庙村民委员会;1994年拐子王乡撤乡建镇改为莲花镇,仍属之。